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黑客帝国三的结局是什么意思？为何尼欧突然就打赢了史密斯了？
尼欧突然就打赢了史密斯，和他的身份有关。
史密斯的“生”
第一部最后尼奥觉醒，变成the One ，最后关头通过进入史密斯的身体，篡改了史密斯的程序，认为消灭了史密斯。然而在第二部，当尼奥惊讶地发现史密斯并没有死，反而更强大且具有近乎无敌的复制能力。但是尼奥并没真正意识到史密斯是自己的黑暗面或者说是反面化身。
直到尼奥在第三部中求教先知才得知答案。让我们整理下Architect与先知说过的话：设计师对尼奥说“你是母体中一些不平衡的方程中不平的那部分，是异常的集合”；先知对尼奥说“他”不能理解任何人的选择，他的使命就是平衡方程式”，“他”就是你，是你的反面，你的负面，是强行让方程式平衡的结果”。我分析到这里，大家大致能猜想到一个结论：史密斯的诞生就是因为尼奥的诞生，也就是始。
史密斯的“死”
最后阶段史密斯进入到尼奥的身体，用自己覆盖了尼奥，以为消灭了尼奥取得了最终的胜利。可惜高兴不到3秒，尼奥.史密斯先生就自爆了。为何？原因是就我上面想要表达的，史密斯因尼奥存在而存在，现在1没有了，自然就不会有-1了。因此史密斯的死，依然是母体再平衡机制的结果。
母体之所以之前无法消灭史密斯其原因与母体无法消灭尼奥是一样的，那就是他们都是母体不完美等式的产物，是自发的、原生的、难以调和的矛盾。由尼奥生--史密斯生到尼奥死--史密斯死的因果过程也与本片的台词“everything that has a beginning has an end 任何事情有开始就有结束”起到遥相呼应的效果。
《黑客帝国》3最后史密斯对尼欧说的话什么意思
以下是个人理解，属于一家之言
记得史密斯去先知家里的情形么？
先知问史密斯：你把莎迪怎么了？
其中一个史密斯就模仿莎迪的语气说了之前莎迪说过的话
这里其实是史密斯想告诉先知，说话的这个人之前就是莎迪，只不过现在被复制了（或者说感染了）
现在回到宿命对决的结尾：
史密斯说自己曾经预见过这一幕，尼奥在那里，然后自己站在这里，是的，这里，然后自己要说些什么呢？“凡事只要有开始就会有结束”（注意，这话之前是先知原创的），史密斯说完这话也觉得不对劲。
所以我认为和尼奥对决的那个史密斯就是被感染的先知。她虽然被史密斯复制了，让史密斯拥有自己的能力（预言），但同时先知并不是一个普通的程序，她依然能够在被史密斯控制的情况下反过来影响史密斯，让史密斯去复制尼奥而不是杀死尼奥，这样一来，机器领袖就能够以被复制的尼奥为媒介去删除史密斯这个失控的程序。
完了，个人见解，仅供嘲笑，不供参考……
黑客帝国3结局先知与造物主的对话是啥意思？
删除病毒的其实是Neo
the one(也就是Neo)具有一定程度控制所处环境的能力，他身处母体二十几年，所以简单训练就可以控制系统中守卫者的子弹（第一部），之后可以更自由地控制。在现实中与母体斗争了几年，所以可以控制乌贼（第三部），先知被感染后，Neo为了锡安的和平与母体谈判，消除病毒（原史密斯），然而在明知打不过的情况下，选择了被感染，这时的Neo所处的是病毒的环境中，所以有控制病毒的能力，他给出的程序指令是：消灭病毒。所以说消灭病毒的是Neo，先知因为病毒的消失而恢复，所以先知是存在的，并没有死。
先知可以探知世界是因为她可以随时接触“进入”母体的人，从而进行人工智能的数据判断。
造物主就不一样了：造物主是最早的人工智能程序，那么就应该知道一点：人工智能是可以实现自我进化的，进化到一定程度的人工智能，可以自我编程，由软件控制硬件，产生自己的眼睛（镜头）、耳朵（话筒）......以此类推，逐渐自我完善（全息化，感知化），逐渐自我升级（可能是“造物主2.0”一类的），逐渐使自我强大起来（“母体”的成型）。实现了软件健全硬件，硬件反过来为软件提供条件的进化过程。或许是因为通过自己的计算得出了“人类的存在必然毁灭地球”的结论（参见《终结者》中的“天网程序”和《我，机器人》中的“V.I.K.I.”），所以产生了“消灭人类”、“囚禁人类”或“控制人类”的计划，从而与人类进行斗争，最后形成了“母体”的硬件、“造物主”的软件、以及不可消除的参数——the one。又通过the one的存在来对自己进行“格式化”以消除自身不可消除的BUG。这就是《黑客帝国》的大背景。然而第N代the one的Neo（具体是第几代我记不太清了），打破了人工智能自己创造出的平衡，这便是第二部的结局与第三步开端的背景，同时造物主还可以创造出不同的人工智能，比如先知、法国人、小女孩等等，只是没有控制硬件的权限。
具体先知和造物主所述内容的意义，我尚未参悟透，或许就是所谓的“因果”与“轮回”吧